Το μουσείο ιδρύθηκε το 1960 προκειμένου να στεγάσει τις αρχαιότητες που μέχρι τότε φυλάσσονταν στα κελιά του μοναστηριού της Εκατονταπυλιανής. Το Μουσείο περιλαμβάνει τις εξής συλλογές:
- Αίθουσα Α: Γλυπτά από την Αρχαία και Κλασική περίοδο.
- Αίθουσα Β: Μικρά κεραμικά και γλυπτά αντικείμενα που χρονολογούνται από τη Νεολιθική, Πρωτοκυκλαδική, Μυκηναϊκή, Γεωμετρική, Αρχαϊκή, Κλασική, Ελληνιστική και Ρωμαϊκή περίοδο.
- Αίθριο: Γλυπτά και αρχιτεκτονικά στοιχεία, τεφροδόχοι / σαρκοφάγοι για ενταφιασμό και δάπεδα με ψηφιδωτά από τη Ρωμαϊκή Περίοδο.
Μερικά από τα πιο σημαντικά εκθέματα είναι:
- Το γλυπτό μιας Γοργόνας περίπου 1,35μ. ψηλό του 6ου αιώνα π.Χ., σε σχεδόν τέλεια κατάσταση. Το γλυπτό ήταν το κεντρικό χαρακτηριστικό του ναού. Βρέθηκε το 1993 κατά τη διάρκεια ανασκαφών σε αρχαίο δημόσιο κτίριο.
- Δύο μαρμάρινες πλάκες από ένα μνημείο του Αρχίλοχου, φτιαγμένες στα τέλη του 6ου αιώνα π.Χ. Η μία δείχνει τον Αρχίλοχο νεκρό και η άλλη ένα ταύρο που κατασπαράσσεται από ένα λιοντάρι. Και τα δύο κομμάτια βρέθηκαν ενσωματωμένα στο δάπεδο της αυλής της Εκατονταπυλιανής.
- Ένα κολοσσιαίο μαρμάρινο άγαλμα της Αρτέμιδος (490-480 π.Χ.) από το Ναό του Δηλίου στην Πάρο ύψους 2,74m (συμπεριλαμβανομένων των πλίνθων). Είναι ένα λατρευτικό γλυπτό που δείχνει τον τύπο της Αρχαϊκής «Κόρης» που φοράει χιτώνα.
- Νεολιθική θηλυκή θεά καθισμένη σταυροπόδι με τα χέρια κάτω από το στήθος της (το ύψος των λειψάνων είναι 0,055m). Βρέθηκε στο νησί Σαλιαγκός ανάμεσα στην Πάρο και την Αντίπαρο.
- Μία «Επιγραφή του Πάριου Χρονικού» που περιέχει ιστορικές, θρησκευτικές και φιλολογικές πληροφορίες που κυμαίνονται από τα προϊστορικά χρόνια μέχρι το 264 π.Χ.. Μία από τις πλάκες εκτίθεται εδώ στην Πάρο και οι δύο άλλες παραμένουν στην Οξφόρδη.
